A lo largo de los 20 años de vida que lleva Intercambios, ha contado con el apoyo de diversos organismos nacionales e internacionales, entre ellos:

Oficina Panamericana de la Salud (OPS)

Oficina de las Naciones Unidas contra la Droga y el Delito (ONUDD)

Programa Conjunto de las Naciones Unidas para el Sida (ONUSIDA) 

Organización Mundial de la Salud (OMS)

Fondo Mundial para el Sida, la Tuberculosis y la Malaria

LUSIDA, Proyecto de Control del SIDA y las enfermedades de transmisión sexual del Ministerio de Salud y Acción Social de la República Argentina

Agencia Nacional de Promoción Científica y Tecnológica del Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación Productiva de la República Argentina

Programa de Fortalecimiento a Organizaciones de la Sociedad Civil, Ministerio de Desarrollo Social del Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires.

Federación Internacional de Universidades Católicas (FIUC)

Ministerio de Ciencia y Tecnología, Consejo Nacional de Desarrollo Científico y Tecnológico del Brasil

Real Embajada de los Países Bajos en Argentina

Embajada Británica en Buenos Aires

GTZ Cooperación Alemana para el Desarrollo

Fogarty International Program – National Institutes of Health – USA

National Development of Research Institute (NDRI)

Fundación Open Society Institute

Asociación Internacional de Reducción de Daños (IHRA)

Comité de ONGs de Viena sobre Drogas (VNGOC)

Transnational Institute (TNI)

Fondo para la Reforma de la Política de Drogas de la Tides Foundation de Nueva York

Curtiembres Fonseca S.A.